La principal labor de las Personerías Municipales es la protección promoción y defensa de los derechos humanos en los territorios. Las Personerías Municipales y FENALPER constituyen la red de Defensores de Derechos Humanos más grande del país.

​La Federación ha buscado proponer estrategias y proyectos orientados a promover la vigencia plena de los Derechos Humanos en los territorios. Paralelamente a este proceso las Personerías tienen como uno de sus retos promover una verdadera cultura de derechos que se arraigue en la ciudadanía y permita la transición a una sociedad más igualitaria e incluyente.